Джутсу или умение/техника - мистическое искусство шиноби, используемое ими в сражениях. Чтобы использовать джутсу, шиноби должен использовать свою чакру. Есть 2 источника чакры: энергия тела, содержащаяся в триллионах клеток и духовная энергия, накапливаемая во время тренировок.

Чтобы применить джутсу, нинзя должен высвободить обе эти энергии. Делая печати руками, нинзя выполняет желаемое джутсу. Невообразимое число печатей и их различных комбинаций дает возможность создавать тысячи различных техник.

Сами по себе техники также взаимодействуют друг с другом. Техника огня сильнее техники ветра, поскольку ветер только раздувает огонь. То есть если равные техники огня и ветра встретятся в поединке, то скорее всего победит огонь. Техника ветра сильнее техники молнии, техника молнии сильнее техники земли, техника земли сильнее техники воды, а техника воды сильнее техники огня.

В зависимости от используемых техник, тип и колличество выделяемой чакры будет различен. Пять основных природных стихий это также названия Пяти Великих Стран Шиноби: Огонь, Ветер, Молния, Земля и Вода. У каждого ниндзя есть предрасположенность к одной из стихий. Для определения этой стихии используется специальная бумага, сделанная из коры деревьев, в которые при выращивании была добавлена чакра. Когда шиноби наполняет такую бумагу своей чакрой, бумага претерпевает различные изменения, в зависимости от предрасположенности ниндзя к той или иной стихии:

-Бумага разорвется на два куска, если ниндзя предрасположен к технике ветра
-Бумага сгорит, если ниндзя предрасположен к стихии огня
-Бумага намокнет, если ниндзя предрасположен к стихии воды
-Бумага рассыпется, если ниндзя предрасположен к стихии земли
-Бумага согнется если ниндзя предрасположен к стихии молнии